חבר הכנסת משה גפני התייחס בחריפות להתנהלות משרד החינוך כלפי מוסדות החינוך החרדיים. גפני טוען כי הדרך שבה מתנהל המשרד אינה מידתית, והביע חשש שהמשרד נהנה מהענקת רישיונות למוסדות החרדיים ושולל מהם רישיונות במקומות שבהם לא צריך להיות כך.
גפני ציין כי מדובר באי-סדר חמור, וכי השר הממונה אינו מוסמך לבצע את ההחלטות הללו. הוא קרא לשר גלעד קיש להפסיק את מה שכינה "היד הנוקשה" ולהתייחס למוסדות החרדיים בכבוד הראוי להם ובאופן שיוויוני.
התגובות למצב זה הולכות ומתרקמות, והחשש מהשפעת התנהלות משרד החינוך על המוסדות החרדיים גדל. כעת, על השר קיש לשקול את צעדיו ולמצוא דרכים שיביאו להרמוניה בין משרדו לבין המערכת החינוכית החרדית.