לוחמי חיל הים פעלו הלילה (בין ראשון לשני) והשתלטו על ספינת המשט לעזה בשם "מדלן", בה הייתה נוכחת הפעילה הפרו-פלשתינית גרטה תונברג. ההשתלטות התבצעה בצורה שקטה וללא תקלות מיוחדות. מטעם משרד החוץ נמסר כי "כל נוסעי 'יאכטת הסלפי' בריאים ושלמים" ושסופקו להם כריכים ומים. המסר היה ברור: "המופע הסתיים".
מראש נערכה מערכת הביטחון במטרה לעצור את המשט, שהוגדר כאנטישמי, בכל אופן. דיווחים מתוך הספינה גילו כי חיל הים התקרב אליה, ובתיעוד מהסיפון נראה אחד הנוסעים, לבוש בחליפת הצלה, מתאר את הנוכחות של ספינות צה"ל בסביבה ואת הפעלת האזעקה. הוא טען: "התחילו עם פשעי המלחמה".
שר הביטחון ישראל כץ הנחה להציג לנוסעים את "סרטון הזוועות" מהטבח ב-7 באוקטובר עם הגעתם לנמל אשדוד. הוא הביעניות על כך ש"ראוי שגרטה האנטישמית וחבריה תומכי החמאס יראו בדיוק מיהו ארגון הטרור חמאס שבו באו לתמוך". כץ שיבח את צה"ל על ההשתלטות המהירה והבטוחה, שנועדה למנוע מהנוסעים לפרוץ את הסגר ולהגיע לחופי עזה.
בנוסף, גרטה תונברג פרסמה סרטון שקרי בו היא טוענת כי נחטפה על ידי כוחות צה"ל והיא מוחזקת בשבי. הסרטון צולם עוד לפני המבצע הצבאי להשתלטות על ספינת 'מדלן', והופץ למרות שמשרד החוץ פרסם תמונה שלה מחייכת לאחר שהכוחות השתלטו על הספינה.
בסרטון תונברג פנתה למדינתה וביקשה שישחררו אותה ואת חבריה לאחר "שנחטפו על ידי כוחות הכיבוש". מנגד, משרד החוץ פרסם תמונה של גרטה מחייכת לאחר שקיבלת מזון ושתייה מכוחות צה"ל, וכן סרטון של הכוחות מחלקים מזון ושתייה לנוסעי הסיפון שנראים רגועים ומחויכים: "כל נוסעי "יאכטת הסלפי" בריאים ושלמים. סופקו להם כריכים ומים. המופע הסתיים", נמסר מטעם משרד החוץ.