במסגרת מלחמת חמאס, התעורר דיון סביב הסיבה לכך שמבנה בו נפלו ארבעה לוחמים לא הותקף מהאוויר לפני כניסת הכוחות. קצין בכיר בצה"ל, בשיחה סגורה, חשף את הסיבה לכך שההתקפה לא בוצעה: "הכרנו את התשתית, ידענו מי נמצא שם, ולא תקפנו, כל פעם מסיבה אחרת – נזק אגבי גבוה". לדבריו, המבנה היה מוכר כתשתית טרור בשטח חאן יונס, והיה זה על הכוונת של פיקוד הדרום מספר פעמים, אך לא קיבל את האישור הנדרש לתקיפה.
השינוי במדיניות התקיפות בצה"ל היה דרמטי. בתחילת הלחימה, ההנחיות אפשרו גמישות רבה יותר, ואילו כיום הוסרו ההנחיות על ידי הפרקליטה הצבאית הראשית, האלופה יפעת תומר ירושלמי, שהחמירה את הכללים. מערך אישורי התקיפה מבוסס כיום על הערכת מספר האזרחים שיכולים להיפגע, כאשר פגיעה במספר גבוה מחייבת אישור אישי של הרמטכ"ל, ופגיעות קלות יותר נדרשות אישורים בדרגה נמוכה יותר.
הקצין הבכיר ציין כי ההנחיות משפיעות על הלחימה בכל רחבי הרצועה. "יש פקודה שמגדירה את מדרגות האש על פי נזק אגבי לאזרחים", אמר. "כל יום, כל היום, עולים יעדים שבשל נוכחות אזרחים אנו לא תוקפים, או לכל היותר מבצעים נוהל 'הקש בגג'". לשאלות בנוגע לאחראים להנחיות, התשובה הייתה ברורה: "הכל בהנחיית הפצ"רית".